Use of chromogenic medium and semi-nested PCR-based assay to identify Candida species

Oliveira, Narjara do Carmo; Rampazzo, Rita de Cássia Pontello; Minari, Mariana Caldas; Corrêa, Paulo Roberto Ceridório; Carneiro, Marcelo; Svidzinski, Terezinha Inez Estivalet; Maia, Luciana Furlaneto; Yamada-Ogatta, Sueli Fumie

Utilização de um meio cromogênico e da técnica de semi-nested PCR para identificação de espécies de Cândida

dc.creator	Oliveira, Narjara do Carmo
dc.creator	Rampazzo, Rita de Cássia Pontello
dc.creator	Minari, Mariana Caldas
dc.creator	Corrêa, Paulo Roberto Ceridório
dc.creator	Carneiro, Marcelo
dc.creator	Svidzinski, Terezinha Inez Estivalet
dc.creator	Maia, Luciana Furlaneto
dc.creator	Yamada-Ogatta, Sueli Fumie
dc.date	2006-12-15
dc.date.accessioned	2022-10-18T19:43:15Z
dc.date.available	2022-10-18T19:43:15Z
dc.identifier	https://ojs.uel.br/revistas/uel/index.php/seminabio/article/view/3511
dc.identifier	10.5433/1679-0367.2006v27n2p125
dc.identifier.uri	http://www.labtecgc.udesc.br/tabd1/handle/123456789/483
dc.description	In this study, the chromogenic medium CHROMagar Candida™ and semi-nested PCR-based assay (sn- PCR) were compared in relation to their capacity to identify the species of 52 clinical isolates of Candida sp. By using the chromogenic medium, 39 (75%) yeasts isolates were presumptively identified as C. albicans (n = 22), C. glabrata (n = 9), C. tropicalis (n = 5) and C. krusei (n = 3). Thirteen isolates (25%) were not distinguishable to the species level. Through the sn-PCR, that is based on the ribosomal RNA genes (5.85 – 28S) cluster amplifications, 43 (83%) isolates were identified as C. albicans (n = 24), C. glabrata (n = 11), C. tropicalis (n = 5), C. parapsilosis (n = 3) and nine isolates could not be identified to the species level. Among the 52 analyzed isolates, 34 (65.4%) were in accordance with both methods, 12 (23.1%) showed discrepant results, and 6 (11.5%) could not be identified by any of the methodologies. The results indicate that both methods are limited, but the sn-PCR is more adequate than the chromogenic medium to identify species of the Candida genus, due to the lowest number of isolates that could not be identified.	en-US
dc.description	Nesse trabalho, o meio cromogênico CHROMagar Candida e a técnica de semi-nested PCR (sn-PCR) foram comparados quanto a sua capacidade de identificar a espécie de 52 isolados clínicos de Cândida sp. Com o emprego do meio cromogênico, 39 (75%) isolados foram identificados presuntivamente como C. albicans (n = 22), C. glabrata (n = 9), C. tropicalis (n = 5) e C. krusei (n = 3). Treze isolados (25%) não puderam ser identificados. Por meio da técnica de sn-PCR, que se baseia na amplificação de uma região do cluster gênico do RNA ribossomal (5.8S – 28S), 43 (83%) isolados foram identificados como C. albicans (n = 24), C. glabrata (n = 11), C. tropicalis (n = 5), C. parapsilosis (n = 3) e nove isolados não puderam ser identificados em nível de espécie. Entre os 52 isolados analisados, 34 (65,4%) apresentaram resultados concordantes pelos dois métodos, 12 (23,1%) apresentaram resultados discrepantes, e 6 (11,5%) não puderam ser identificadas por nenhuma das duas metodologias. Os resultados indicam que ambas as técnicas apresentam limitações, mas o método de sn-PCR é mais adequado que o meio cromogênico para a identificação de espécies do gênero Candida, devido ao menor número de isolados que não puderam ser identificados.	pt-BR
dc.format	application/pdf
dc.language	por
dc.publisher	Universidade Estadual de Londrina	pt-BR
dc.relation	https://ojs.uel.br/revistas/uel/index.php/seminabio/article/view/3511/2844
dc.rights	Copyright (c) 2016 Semina: Ciências Biológicas e da Saúde	pt-BR
dc.source	Semina: Ciências Biológicas e da Saúde; Vol. 27 No. 2 (2006); 125-132	en-US
dc.source	Semina: Ciências Biológicas e da Saúde; v. 27 n. 2 (2006); 125-132	pt-BR
dc.source	1679-0367
dc.source	1676-5435
dc.subject	Candida sp. Identification. CHROMagar médium. Semi-nested PCR.	en-US
dc.subject	Candida sp	pt-BR
dc.subject	Identificação	pt-BR
dc.subject	Meio CHROMagar	pt-BR
dc.subject	Semi-nested-PCR.	pt-BR
dc.title	Use of chromogenic medium and semi-nested PCR-based assay to identify Candida species	en-US
dc.title	Utilização de um meio cromogênico e da técnica de semi-nested PCR para identificação de espécies de Cândida	pt-BR
dc.type	info:eu-repo/semantics/article
dc.type	info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type	Artigo avaliado pelos Pares	pt-BR

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Semina: Ciências Biológicas e da Saúde
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